Produk

Analisis acara fosforilasi proteome isih dadi tantangan analitis utama amarga kerumitan jaringan fosforilasi protein sing gedhe banget.Ing karya iki, kita ngevaluasi komplementaritas Lys-N, Lys-C, lan trypsin babagan kemampuane menehi kontribusi kanggo analisis global fosfoproteome.Versi olahan saka ijol-ijolan kation kuwat pH rendah digunakake kanggo misahake peptida asetilasi, fosforilasi, lan nonmodified N-terminal kanthi efisien.Gunggunge 5036 fosfopeptida nonredundant bisa diidentifikasi kanthi tingkat panemuan palsu <1% saka 1 mg protein nggunakake kombinasi telung enzim kasebut.Data kita nyatakake yen tumpang tindih antarane set data fosfopeptida sing diasilake karo protease sing beda-beda ana marginal, dene tumpang tindih antarane rong set data tryptic sing padha ditemokake paling ora kaping 4 luwih dhuwur.Kanthi cara iki, panggunaan paralel Lys-N lan trypsin bisa nambah 72% jumlah fosfopeptida sing dideteksi dibandhingake d karo tripsin wae, dene eksperimen replikasi trypsin mung nyebabake kenaikan 25%.Mangkono, nalika fokus mung ing data trypsin lan Lys-N, kita nemtokake 4671 fosfopeptida nonredundant.Analisis luwih saka situs sing dideteksi nuduhake yen set data Lys-N lan trypsin diperkaya ing motif fosforilasi sing beda banget, luwih mbuktekake manawa pendekatan multiprotease migunani banget ing analisis fosfoproteome.